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注册公司可以去以下部门。

1、工商行政管理机关：这是注册公司的最主要部门，负责公司的注册和管理。

2、市场监督管理总局或其下属的工商管理部门：负责企业注册登记的受理、审查、审批等，不同地区的企业注册可能需要去不同的市场监督管理分局进行办理。

注册公司需要去当地的工商行政管理部门或市场监督管理总局进行办理，如果对具体流程和所需材料有疑问，建议提前查询当地的相关政策和要求。